科目代號：H01
英文名稱：Ancient Church History with Patrology
授課時間：每年第一學期
學分數：２學分（神學系、教義學系牧靈組一年級必修；
教義學系福傳組二年級必修）
在此地區所教的教會歷史有具體的目的。向過去的歷史經驗學習，以反省並創造中國教會的現在以及未來。為了達到此目的，介紹六個主題：
- 教會與古代文化；幫助學生反省本地化的問題（教會與文化的相互影響）。
- 教會與政府；教會面對敵視的或友善的政府時，如何保持外在及內在的自由。
- 教會與組織：教會如何意識到自己是怎樣的團體，如何保持良好的傳統，同時如何肯定其新穎。
- 教會與教義：教會面對所出現的謬論，如何意識到其信仰的內容及如何表達，此以首六屆大公會議以及教父學為基礎。
- 教會與生活：靈修、禮儀、傳教及修會生活的沿革。
- 教會與藝術：在藝術上看初期基督徒的信仰生活。
科目代號：H02
英文名稱：Medieval and Modern Church History
授課時間：每年第二學期
學分數：２學分（神學系、教義學系牧靈組一年級必修；教義學系福傳組二年級必修）
課程簡介：
中世紀乃至近代、現代一千多年的政治與社會文化變遷，廣泛且深入地影響教會對自我身分的認知與對外展現的面貌。本課程就教會與政治、組織、教義、社會人文思想的關係，依照歷史時序探討攸關教會的指標性事件：中世紀封建制度下的教會、16世紀宗教改革、地理大發現時期的教會傳教工作、啟蒙運動、西歐由封建制度走向民族國家的發展，特重教會近代三次大公會議，以及主題探討現代教會對梵二教導的落實。
課程目標：
藉著本課程的學習，期待同學加強對教會身分本質的認知與認同；並能習得「探究」與「思辨」歷史的能力，以古鑑今，了解形成現代教會與世界關係的因果，合理解釋歷史問題；同時有效運用歷史資料，進一步分辨實踐天主國的未來走向，得為跨界對話及本地化福傳效力之益。
課程方法：
課堂基本資料解說，鼓勵同學興趣延伸閱讀，紀錄片觀看，小組討論與主題研究報告。
科目代號：H21
英文名稱：History of the Christian Mission in China
授課時間：三年級第二學期；每年開課
學分數：２學分（神學系必修；教義學系必修）
本學科探討福音流傳中國的歷史，以天主教史為主，但亦講述景教、東正教及基督教。
本學科區分為：
- 景教在中國。
- 蒙元時期的天主教。
- 明末迄今的天主教（包括教難的原因及中國與教廷使節史）。
- 東正教在中國。
- 基督教在中國。
- 天主教與基督教在台灣。